想请教一下基因组SNP分析基本方法和流程是？ - 知乎
Jul 2, 2024 · SNP下游分析 | 利用VCF文件进行构建系统进化树 在之前的一篇推文中，我们学会了如何使用GATK软件对测序数据（基因组测序和转录组测序均可）进行变异分析（SNP、InDel），同时提 …
孟德尔随机化研究 - 知乎
上一期我们已经筛选完了P值小于5e-8，maf>0.01的SNP（也即pQTL）, 现在我们需要把这些pQTL分成cis和trans。 Decode蛋白质pQTL数据处理完整代码（一） - 知乎 …
SNP (单核苷酸多态性)这个现象在生物领域可以用作什么研究，能够解 …
SNP（单核苷酸多态性）是生物领域中常见的遗传变异类型，指的是基因组中单个核苷酸（A、T、C、G）的变异。SNP的存在可以用于各种研究，并且可以解决许多问题，包括： 遗传疾病研究：SNP …
目前SNP检测技术都有哪些? - 知乎
针对SNP的研究可以分为2大类： 1、对未知SNP的分析，包括发现新的SNP位点和确定某一未知SNP和某种遗传疾病之间的关系； 2、对已知SNP的分析，包括对不同群体SNP的遗传多样性研究和遗传疾 …
SNP（单核苷酸多态）分析能得到什么信息？ - 知乎
SNP分析最直接的能能到的信息是，群体内，不同个体间的碱基的变化信息，那通过这些我们能做哪些应用呢？ 个体识别和亲缘关系鉴定: 个体识别这个在刑侦中应该大家还听得挺多的，通过比较案发现场 …
能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀，如何理解呢？
2， SNP位置不一定在gene上，可能在基因之外的区域，也会有作用。 3， 基因型（T,A,G）不一定是来自父母，可能会自发突变，和爹妈都不一样。 rs编号里不一定包括了所有的突变类型，甚至数据库 …
bcftools 怎么用？ - 知乎
Apr 11, 2023 · bcftools 怎么用？ samtools mpileup -f genome.fa -Q 0 -vu map.sortP.bam >snp.vcf 这是用samtools的命… 显示全部 关注者 3 被浏览
如何批量查询SNP对应的基因名或者基因ID？ - 知乎
May 3, 2022 · 如何批量查询SNP对应的基因名或者基因ID？ 请问是否有方便的批量查询SNP对应基因信息的方法，如基因名，ID，该SNP的位置，突变频率等。 另外想问下大佬们有无能通过基因名批量 …
如何解读 SNP 基因分形的技术原理？ - 知乎
SNP基因分型技术是一种常用的SNP检测方法，它可以快速、准确地检测SNP位点的基因型。 SNP基因分型技术的原理主要包括PCR扩增、限制性内切酶切割和凝胶电泳等步骤。
有大佬做过SNP位点分析吗？有15个基因组，要找某些基因的snp位点 …
Oct 26, 2020 · 因此，它们经常用于使用基因组规模的 SNP 数据（例如来自全基因组测序或 RADseq）来测试基因渗入。 在本次实践 [1]中，我们将结合使用可用软件和一些用 R 从头编写的代码来执行 …